碳源是指向大气中释放碳的过程、活动或机制。自然界中碳源主要是海洋、土壤、岩石与生物体，另外工业生产、生活等都会产生二氧化碳等温室气体，也是主要的碳排放源。这些碳中的一部分累积在大气圈中，引起温室气体浓度升高，打破了大气圈原有的热平衡，影响了全球气候变化。

是微生物生长一类营养物，是含碳化合物。

常用的碳源有糖类、油脂、有机酸及有机酸酯和小分子醇。

根据微生物所能产生的酶系不同，不同的微生物可利用不同的碳源。

碳源对微生物生长代谢的作用主要为提供细胞的碳架，提供细胞生命活动所需的能量，提供合成产物的碳架。

碳源在制作微生物培养基或细胞培养基时有重要的作用，为微生物或细胞的正常生长，分裂提供物质基础。

硝化反硝化脱氮是高效的生物脱氮技术，目前在污水处理领域有着广泛的应用。在微生物脱氮方面，进行反硝化作用时，异养反硝化菌需消耗做为碳源并提供能量的外加有机物。以补充碳源的方式提高反硝化速率，但是如果外投碳源过量或选择碳源不当，不但增加了系统运行费用，还使污水处理厂COD有超标风险。